哈利路亞，感謝主，斗六教會能夠成立，全是主的恩典與奇妙的帶領。茲略述其沿革如下：

斗六教會的信徒原屬虎尾教會，1976年7月斗南教會成立時，併屬斗南，當時斗六信徒有4戶12名。斗六是雲林縣府所在地，因遷居來此的信徒日增，乃於1987年6月成立「斗六祈禱所」，借用陳嫦娥姊妹宅為聚會所在，每週二、四晚上及安息日下午聚會。當時信徒有11戶37名。

當斗南教會建堂時，其基金已逾預算目標。而斗六信徒亦有感成立教會的必要，於1989年9月16日在斗南教會召開臨時信徒大會，提出「成立斗六教會」案。全體信徒明白成立教會以廣傳福音的重要，經決議：

1.在斗六覓得適當場所，即可成立教會。
2.斗南舊會堂土地出售後，將一半的款項給斗六。

感謝主奇妙的安排，過了幾天，斗南舊會堂土地即以高價售出，斗六迅速獲得建堂基金。同年10月10日成立「建堂委員會」，在主的帶領下於10月20日購得現今之會堂，並於1990年1月20日正式成立斗六教會。

斗六教會成立迄今信徒有30戶96名。晚間聚會週二是家庭聚會、週三是講道聚會、週五是唱詩祈禱會或見證會；週六是安息日聚會；晚間有青年詩班練詩。宗教教育有幼稚班、幼年班、少年班、初級班；教員有19名，學員共有37名。

願主繼續施恩賜福斗六教會，加添祂的選民，使聖工更加活潑興旺，使主名得榮耀。願將一切榮耀歸於主耶穌基督聖名，阿們！