1936年，真道傳到彰化縣鹿港鎮的草港尾、烏瓦厝、山寮等附近地區。當時來信主的大部分是因病或受魔鬼干擾，求助「神明」無效才來慕道。

1946年，崙尾簡便的會堂無法容納信徒聚會，在當地又找不到合適的私有土地，由於崙尾和烏瓦厝屬同一里，兩地近在咫尺，所以轉而到烏瓦厝興建一所當時所謂的「大會堂」，在1947年完工，即今日的「草港教會」。原來崙尾的會堂改為崙尾晚上聚會用，因此，會址由崙尾遷移到烏瓦厝，名稱仍是「崙尾教會」。

據1956年6月至1957年10月駐牧的陳職傳道(現在的陳桂道長老)說：「那時晚上聚會後，都將椅子搬到後面，挪出空地，求聖靈，前後禱告兩次，每次半小時。聖靈非常充滿，有靈歌、靈舞、靈笑、靈哭、看異象。」

後來，信徒漸漸增加到約六百人，會堂容納不下，住在崙尾的信徒，有遷回的意願，遂於1965年，經信徒會議決定在崙尾建一所新會堂，另成立「崙尾教會」，原來的會堂改稱「草港教會」。
1984年12月4日起，從草港教會分出的尾庄祈禱所，是在黃阿模弟兄家舉行家庭聚會，1985年5月9日成立「草港尾祈禱所」。但借用住宅非長久之計，後來信徒會議決定購買草港尾車站斜對面，一棟時價295萬元的三層樓，在1988年2月17月(農曆年初一)獻堂，做「祈禱所」用。

草港教會原來的會堂不敷使用，在1986年5月3日，開會決定在原地改建。1989年1月6日動工，1991年1月竣工，建地430坪，總工程費1,250萬元。同年2月17日(農曆年初三)獻堂。願一切的奉獻、禱告、感恩，蒙神悅納。阿們！